Институт паразитологии РАН cоздан в 1991 на базе Лаборатории гельминтологии АН СССР, основан в 1943 академиком К.И. Скрябиным.

Исследования по видовому составу паразитов, их морфологии, распространению, систематике, эволюции, взаимоотношениям друг с другом и с хозяевами, а также по разработке экологически чистых методов ограничения численности наиболее патогенных видов.

Лаборатория паразитологии Зоологического института РАН была создана в 1930 г. по инициативе действительного члена Академии Наук СССР Евгения Никаноровича Павловского. Основные задачи лаборатории - разработка фундаментальных вопросов морфологии, экологии, систематики и фауны паразитических и кровососущих клещей и насекомых. Теоретическую основу направления, называемого "школой Е.Н. Павловского в паразитологии", составляет разработанное им учение о природной очаговости трансмиссивных болезней.

За 70 лет своего существования сотрудниками лаборатории была опубликована 41 монография, подготовлено 13 докторов и 30 кандидатов наук.